La troisième génération possède presque autant de pokémons légendaires que les deux premières réunies, mais ils sont assez intéressants pour être utilisés en combat. Nous retrouvons ainsi deux « clans » de Pokémons élémentaires, les Golems d'un côté, composés de Regirock, Registeel et Regice, des pokémons très résistants mais très, très lents, et les pokémons de « matière », véritables stars de cette génération, Kyogre (Dieu des Océans), Groudon (Dieu de la Terre) et Rayquaza (Dieu des airs).
Les golems, de gauche à droite, Regice (n°378), Registeel (n°379) et Regirock (n°377). Leurs yeux sont des lettres en braille, car il faut décrypter des petites énigmes écrites dans cette langue pour les trouver.Groudon (n°383, le rouge), Kyogre (n°382, le bleu) et Rayquaza (n°384, le vert). Leur bataille est l'arrière-plan mythologique de cette génération.
Comme précisé auparavant, il faut attendre la version Émeraude pour pouvoir les attraper tous trois, dans les autres versions ce sont des créatures « emblèmes », spécifiques à un jeu en particulier et ce à l'exception de Rayquaza. Nous avons ensuite les « jumeaux maîtres », en réalité très proche de Mewtwo dont ils seraient une version « gentille », Latias et Latios. Ce sont deux oiseaux qui se rencontrent au hasard des routes. Ils sont très rapides et, à nouveau, chacun est spécifique à une version en particulier.
Latias (n°380) et Latios (n°381). Le premier est féminin, le second masculin : bien que l'on ne puisse les faire s'accoupler, ce sont les premiers pokémons légendaires sexués. Le pokémon « génération de Mew » est ici Jirachi et, comme de coutume, l'on ne peut l'obtenir que par un événement organisé par Nintendo, événement auquel je n'ai pas participé.
Jirachi (n°385)... J'avoue qu'il n'a jamais su me faire rêver comme Mew. Pour mémoire, il faut citer un dernier pokémon, cette fois-ci plus proche de Mewtwo, y compris de son histoire (une modification génétique d'un organisme extraterrestre) mais accessible par un événement à nouveau, Deoxys.
Deoxys (n°386), qui peut prendre plusieurs formes en le faisant s'approcher d'une météorite.